El Museo de Historia de Aguadilla tiene como misión rescatar, preservar estudiar y difundirla historia y las prácticas culturales que han contribuido a forjar el perfil tan singular de nuestro pueblo. El museo también tiene la misión de ofrecer a sus visitantes y la comunidad en general experiencias educativas variadas que amplíen sus conocimientos y perspectivas de nuestra historia y cultura. Contribuir a su formación cultural y ética para generaciones presentes y futuras tan necesaria para todos en nuestra vida como ciudadanos del mundo.
El Museo de Historia de Aguadilla asume el compromiso de realzar nuestra identidad como pueblo mediante la exhibición, conservación del patrimonio tangible e intangible de Aguadilla la historia a la que pertenecemos. El museo utiliza una perspectiva histórica para interpretar nuestra compleja realidad como pueblo y brindar una valiosa experiencia educativa a sus visitantes. Esta visión reconoce que Aguadilla y sus expresiones culturales son el producto histórico de la confluencia de una diversidad de personas e ideas y promulga esa diversidad como elemento clave y enriquecedor de nuestra idiosincrasia.